Nước đun sôi để nguội cần được bảo quản trong vật chứa sạch, kín, tránh tái nhiễm lại các loại vi khuẩn và các mầm bệnh khác từ môi trường bên ngoài. Nước đun sôi để nguội chỉ nên uống trong ngày, không trữ thời gian lâu vì dễ tái nhiễm vi khuẩn và các mầm bệnh khác từ môi trường bên ngoài.